Jam layanan: 07:30-15.00 (Senin-Kamis) dan 7:30-15:30 (Jumat)

Abstrak DNA Barcoding Ikan Pantai Barat Sumatra

Chapter 2015 with 410 download times

Authors

,Arif Wibowo,Siswanta Kaban,

Ikan  merupakan  kelompok  vertebrata  yang  sangat  beragam  yang  menunjukkan  perubahan fenotipik  yang  mendalam  selama  fase  pengembangannya.   Dalam  konteks  ini,  identifikasi spesies  ikan  menjadi  sesuatu  yang  menantang  dan  Identifikasi  spesies yang  akurat  tetap penting untuk menyelidiki kondisi keanekaragaman hayati dan konservasi. Sampai saat ini, pendekatan  taksonomi  tradisional  mengandalkan   sebagian  besar  pada  karakter  diagnosik morfologi,   memerlukan   pengetahuan   ahli   untuk  mengidentifikasi   spesimen.   Selain   itu, pendekatan  morfologi untuk tugas identifikasi  spesies rutin memiliki keterbatasan  yang nyata. Metode identifikasi spesies ikan yang didasarkan pada keragaman urutan dalam fragmen DNA tunggal sitokrom  c oksidase subunit I (COI) pada mtDNA merupakan  metode identifikasi  ikan yang  efektif  dan  akurat,  metode  ini  di  kenal  dengan  istilah  DNA  barcoding.  Penelitian  ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan menginisiasi data base (library/referensi COI) spesies ikan air  tawar  pantai barat  Sumatra  berdasarkan  DNA  barcoding.  Ikan  air  tawar  memberikan kesempatan  yang baik untuk menguji keakuratan  analisi barcode  berbasis  delimitasi  spesies dan  identifikasi  selama  rentang  geografis  yang  luas..  Penelitian  ini telah  menunjukkan  DNA barcode efektif membedakan ikan air tawar dari pantai Barat Sumatera. DNA barcoding mampu mengidentifikasi spesimen juvenil ikan dari Sungai Bantal kedalam spesies Kuhlia malo dengan tingkat kemiripan sekuen 98.5%. Namun demikian secara keseluruhan identifikasi ikan menggunakan  DNA  barcoding  hanya  mampu  mengidentifikasi  ikan  sampai  tingkat  spesies sebesar 16.67%. Dengan menggunakan  metode ini jelas akan memungkinkan  identifikasi ikan pada semua tahapan perkembangan,  seperti telur ikan air tawar yang terisolasi, fillet larva dan sirip ikan.

Kata kunci : COI dan identifikasi ikan, molekuler